Il secondo e ultimo fu proprio Alberto Zaccheroni. Dopo una grande stagione con l'Udinese viene chiamato ad allenare il Milan, dove vince lo scudetto nel 1999. Dopo non pochi scontri con Silvio Berlusconi viene sollevato dall'incarico nel marzo 2001. La sua esperienza all'Inter iniziò nell'ottobre 2003. A fine stagione, nonostante la conquista della Champions League, rassegnò le proprie dimissioni.